In het kader van het programma Deltanatuur zijn langs het Haringvliet, het Hollands Diep, de Oude Maas, de Noord en in de Biesbosch een groot aantal nieuwe waterrijke natuurgebieden aangelegd die bijdragen aan de doelstellingen van Natura 2000 en de KRW, het vergroten van de waterveiligheid en veel ruimte bieden voor recreatie en groenbeleving. Dit programma omvat in totaal 23 projecten met een gezamenlijke oppervlakte van ruim 2.000 ha en is in 2000 van start gegaan. In 2005 is de regie op het programma Deltanatuur door LNV overgedragen aan de provincie Zuid-Holland. Inmiddels zijn alle projecten behalve de Buttervlietpolder afgerond. De projecten zijn uitgevoerd in nauwe samenwerking met Rijkswaterstaat WNZ, de provincie Noord-Brabant, gemeenten, waterschappen, natuurorganisaties en omwonenden. Alle Deltanatuurgebieden behoren tot het NNN, en het merendeel ook tot Natura 2000 (Oude Maas, Haringvliet, Hollands Diep en Biesbosch).
Aan het einde van deze paragraaf wordt ook nog even kort ingegaan op de stand van zaken bij de uitvoering van het Droomfondsproject Haringvliet en de integrale gebiedsontwikkeling van de Leenheerenpolder en omgeving. Dit zijn strikt genomen geen Deltanatuurprojecten, maar wel vergelijkbaar qua doelstellingen, en ze zijn of worden deels gerealiseerd met provinciale cofinanciering.

Spuimonding-oost (Leenheerengorzenpolder en Leenheerenbuitengorzen, 61 ha.):
Er is in 2018 een openbare procedure doorlopen om het gebied te kunnen overdragen aan een eindbeheerder, maar dit heeft niet tot het gewenste resultaat geleid. Het gebied is daarom in 2019 opnieuw in tijdelijk beheer gegeven aan de aannemer. De overdracht aan een eindbeheerder zal nu worden gekoppeld aan het lopende gebiedsproces in de Leenheerenpolder.

Buttervlietpolder (21 ha):
De Buttervlietpolder zou conform toezegging aan PS via een DBM-contract (Design, Build en Maintain) worden aanbesteed. In de eerste helft van 2019 is de gunningsprocedure verder voorbereid, zijn na intensief overleg met Rijkswaterstaat WNZ de laatste plooien gladgestreken (aanpak van de bodemverontreiniging en compensatie voor het berekende verlies aan waterbergend vermogen) en kon een uitvoerbaar en vergunbaar project in de markt worden gezet. Op 6 september 2019 is de verkoopbrochure gepubliceerd. Op 10 januari 2020 is de online inschrijving gesloten. Hoewel meerdere partijen in het voortraject belangstelling hadden getoond zijn er uiteindelijk geen geldige inschrijvingen binnengekomen.

Droomfondsproject Haringvliet
Het Droomfondsproject Haringvliet is uitgevoerd door zes organisaties - WWF, Natuurmonumenten, Sportvisserij Nederland, Vogelbescherming Nederland, Staatsbosbeheer en ARK Natuurontwikkeling - met steun van de Nationale Postcodeloterij en omvatte een hele set aan maatregelen om de biodiversiteit in en rond het Haringvliet te versterken en de recreatieve bereikbaarheid, toegankelijkheid en beleving van het gebied te vergroten. Het Droomfondsproject is in 2019 afgerond. De provincie Zuid-Holland heeft via het programma van de Landschapstafel Haringvliet en een specifieke Natura 2000-overeenkomst met Natuurmonumenten aan enkele projecten een financiële bijdrage geleverd. De trigger voor dit project was de inwerkingtreding van het Kierbesluit in het najaar van 2018. De laatste twee projecten, de inrichting van een nieuw natuurgebied in de Zuiderdieppolder, het zogenaamde Blok de Wit (63 ha, exclusief de zoekgebieden voor de nog te plaatsen windturbines) en de uitvoering van omvangrijke herstelmaatregelen op de Korendijkse Slikken (90 ha) zijn in het voorjaar van 2019 opgeleverd en feestelijk geopend. Blok de Wit is in 2019 na inrichting extra toegevoegd aan de NNN-begrenzing. In 2018 was in de monding van het Spui al het nieuwe vogeleiland Bliek aangelegd (3,6 ha, waarvan 2 ha boven water), hadden delen van de Bommelse Gorzen (Spuigors en Nieuwe Stadse Gors), de Westplaatbuitengronden en de Menheerse Plaat al een flinke kwaliteitsimpuls gekregen en waren er in de Voordelta enkele experimentele schelpdierbanken aangelegd. Het Droomfondsproject Haringvliet zal ongetwijfeld sterk bijdragen aan het bereiken van de Natura 2000-doelen voor het Haringvliet.

Leenheerenpolder
De minister van LNV heeft begin augustus 2019 het wijzigingsbesluit voor het Natura 2000-gebied Haringvliet definitief vastgesteld. Daarmee zijn de Leenheerenpolder, het Spuigors en het tussengelegen deel van het Spui formeel aan het Natura 2000-gebied Haringvliet toegevoegd. In de regio bestaan vergevorderde plannen voor een integrale gebiedsontwikkeling van de Leenheerenpolder en omgeving. De nieuwe begrenzing laat hiervoor voldoende ruimte. Een belangrijk onderdeel van de plannen is het realiseren van een groot zoetwatergetijden-gebied met de habitats en soorten waarvoor het Haringvliet is aangewezen. In het Kaderbesluit Groen 2018 is een reservering van € 10 mln opgenomen voor de provinciale bijdrage aan de realisatie van het nieuwe natuurgebied in de Leenheerenpolder en een kwaliteitsimpuls voor het Spuigors. In het voorjaar van 2020 zal met de gebiedspartijen een samenwerkingsovereenkomst worden gesloten voor de plan- uitwerkingsfase en moet overeenstemming worden bereikt over de inbreng van onze grondpositie binnen de integrale gebiedsontwikkeling. Het initiatief voor de uitvoering van de plannen blijft bij de regio.